Le trypanosome se recherche dans le sang, les ganglions, le LCR.
L’examen de sang se fait à l’état frais entre lame et lamelle, et après différentes techniques d’enrichissement :
D’autres techniques sont plus rarement employées : mise en culture sur milieux spéciaux, inoculation à l’animal.
Il est capital pour permettre le choix du traitement et nécessite la réalisation d’une ponction lombaire.
Dans le LCR, la présence de trypanosomes (après éventuel enrichissement par centrifugation), le nombre de cellules, les anticorps, le taux d’IgM sont recherchés. La présence de trypanosomes dans le liquide cérébrospinal signe le passage en seconde phase.
Un taux élevé d’IgM, une numération des leucocytes supérieure à 5/mm3, sont également considérés comme marqueurs de la phase neurologique.
L’efficacité du traitement sera évaluée dans le sang et le LCR, sur la disparition des trypanosomes, la décroissance régulière du taux des anticorps, la normalisation des paramètres biochimiques. Le suivi doit être assuré sur une période de 2 ans.