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La splénectomie expose à des infections sévères et parfois foudroyantes (septicémies, méningites), liées en particulier à des germes encapsulés (pneumocoque, méningocoque) et à Haemophilus influenzae.
Elle consiste en une vaccination antipneumococcique (ne couvre pas tous les sérotypes) avant la splénectomie si possible, associée à une vaccination anti-Haemophilus influenzae chez l’enfant ou le patient immunodéprimé. Elle est associée à une antibioprophylaxie par pénicilline orale (on la conseille en général jusqu’à l’adolescence chez l’enfant, et pendant 1 ou 2 ans chez l’adulte). Une éducation du patient, en cas de fièvre, est nécessaire (information sur une carte).
On emploie une céphalosporine de troisième génération à dose adaptée (risque de pneumocoque à sensibilité diminuée à la pénicilline). L’antibiotique doit être adapté dès que le germe est identifié. L’asplénie fonctionnelle (par exemple lors des drépanocytoses après infarctus splénique) pose les mêmes problèmes infectieux.