La gutta-percha utilisée en endodontie, essentiellement sous forme de cône, a pour composition :
Certains fabricants ajoutent des anti-microbiens, comme l'hydroxyde de calcium, la chlorhexidine ou l'iodoforme. La composition est variable d'un fabricant à l'autre (polymères, additifs, et traitements physico-chimiques). Elle explique la biocompatibilité, la non-résorbabilité, les mauvaises qualités mécaniques et le manque de stabilité. La qualité d'un cône de gutta-percha dépend des proportions relatives d'oxyde de zinc et de gutta-percha. Plus la proportion de gutta-percha augmente, moins le cône est malléable, et plus il est dur et peu thermoplastifiable.