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La formation d’un organe débute à partir d’un massif cellulaire indifférencié (blastème rénal, pulmonaire, etc.). Celui-ci subit des phénomènes d’induction sous la dépendance d’un tissu voisin déjà différencié. Par exemple, dans le rein, le bourgeon urétéral (diverticule du canal de Wolf) pénètre dans le blastème rénal et induit la différenciation des néphrons.
Entre le début du développement d’un organe et son achèvement, se produit souvent une série d’événements reliés entre eux. Leur perturbation pourra être à l’origine de malformations diverses :
Remarque
Le terme de dysplasie désignait étymologiquement uniquement les lésions tissulaires résultant d’une anomalie du développement. Cependant, le terme de dysplasie est aussi utilisé actuellement pour désigner des anomalies acquises de la différenciation et de la prolifération cellulaire qui sont des lésions pré-cancéreuses (cf. chapitre 9, « Histoire naturelle du cancer »).
On peut classer les principales variétés de malformations selon leur mécanisme de formation :