Aux protéases de Prevotella, Porphyromonas, Peptostreptococcus, Fusobacterium et Enterococcus, il faut ajouter l'action d'autres enzymes, par exemple la hyaluronidase, la chondroïtine sulfatase, la glycuronidase, et la DNase, de Streptococcus, Propionibacterium, Prevotella, Porphyromonas et Fusobacterium.
Parmi les nombreux moyens dont disposent les bactéries pour échapper aux défenses de l'hôte, on peut citer la présence de capsule pour Prevotella, Porphyromonas, Eikenella et Peptococcus, ainsi que la production de protéases neutralisant les immunoglobulines et certaines protéines anti-inflammatoires pour Porphyromonas. Prevotella et Porphyromonas sont aussi capables de résister à l'action du complément.
La virulence des BPN pourrait s'expliquer par leur capacité à résister à la phagocytose ou par une action inhibitrice vis-à-vis des leucocytes. Des souches de Prevotella melaninogenica et Prevotella oralis productrices de béta-lactamase ont été isolées d'abcès périapicaux.